本目录存放整体研究设计、假设体系、方法论选择和发表规划文档。它是整个研究项目的"蓝图"——定义了从数据到论文的完整路径，包括六个分析阶段(Phase I–VI)和四篇计划论文的选题规划。
后续研究人员应将本文档作为项目导航地图来使用。
- 内容: 完整研究框架文档
- 语言: 英文为主，部分注释中文
- 结构: 10 个章节
章节纲要:
| 章节 | 内容 |
|---|---|
| Executive Summary | 项目总览：32,459条记录、多维数据、广西特殊性 |
| 1. Background & Rationale | 全球/中国/广西三层背景 + 四大知识空白 |
| 2. Study Design | 回顾性队列设计、纳入标准、数据维度表（7类数据、16万+检查） |
| 3. Research Objectives & Hypotheses | 3个主要目标 + 3个次要目标 + 2个探索性目标 + 6个可检验假设(H1-H6) |
| 4. Analytical Framework | 六阶段分析流程: Phase I(清洗) → II(描述性) → III(biomarker) → IV(经济负担) → V(高级分析: EFA/聚类/网络/生存/ML) → VI(知识图谱) |
| 5. Methodology | 统计方法-工具对照表（11种方法 × Python实现） |
| 6. Expected Deliverables | 四篇论文发表规划 + 数据产品 + 代码仓库 |
| 7. Ethical Considerations | 伦理审批、数据脱敏、合规性 |
| 8. Key Preliminary Findings | 7项初步核心发现 |
| 9. Timeline | 16周实施计划 |
| 10. References | 10篇奠基性文献 |
| 论文 | 聚焦 | 目标期刊 |
|---|---|---|
| Paper 1 | 流行病学刻画与时间趋势 | Schizophrenia Research / Epidemiology and Psychiatric Sciences |
| Paper 2 | 实验室生物标志物与内分泌特征 | Psychoneuroendocrinology / J Psychiatric Research |
| Paper 3 | 经济负担与医疗不平等 | Social Psychiatry and Psychiatric Epidemiology |
| Paper 4 | EFA与网络分析的患者分层 | Translational Psychiatry / NPJ Schizophrenia |
[本步骤] 04_research_framework (研究设计 — 项目最先制定)
↓ 指导
00_raw_data → 01_cleaned_data → 02_figures → 03_manuscript
本文档在逻辑上是最先产生的（先有设计，再有执行），但实际上与数据探索同步迭代——初步数据profiling的发现反馈到了假设设定和分析框架的设计中。
- 如果你要继续本项目: 从 Phase V (Advanced Analytics) 开始——EFA、聚类、网络分析、生存分析、机器学习部分尚待实施
- 如果你要投稿 Paper 1: 参照 Phase II + Phase IV 的方法论，结合
03_manuscript/Article_Sections.md中的 Results/Discussion - 如果你要扩展数据: 本框架中的 Phase III (Biomarker Analysis) 为后续整合外部数据（如基因组、影像学）预留了接口
- 如果你要复现分析: 所有 Python 代码逻辑记录在
05_process_log/Data_Cleaning_Log.md中